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目前臨床上對于各種瘧疾的治療，主要包括基礎(chǔ)治療和抗瘧原蟲治療，基礎(chǔ)治療主要是一般支持及對癥治療，包括發(fā)作期及退熱后24小時，應(yīng)臥床休息，注意補(bǔ)充水分，抗瘧原蟲治療是瘧疾治療的核心，選藥原則根據(jù)診斷是否為惡性瘧疾，血中瘧原蟲密度大小，病情輕重，是否來自耐藥流行區(qū)，當(dāng)?shù)丿懺x的耐藥類型，當(dāng)?shù)厮幍目杉靶詠磉x擇藥物。
世界衛(wèi)生組織建議使用青蒿素衍生物與另一種有效抗瘧疾藥物的聯(lián)合方案，是目前最有效，并且可以避免瘧原蟲產(chǎn)生耐藥性的方法，目前治療瘧疾的常用藥物主要包括兩大類：第一、殺滅紅細(xì)胞內(nèi)裂體增值期瘧原蟲的藥物，可控制臨床發(fā)作，主要品種有青蒿素及其衍生物，以青蒿素為基礎(chǔ)聯(lián)合藥物治療，是近年來全球瘧疾控制取得成功的重要因素，可根據(jù)病情輕重或急緩，選用口服肌注或靜脈注射，還有氯喹、鹽酸甲氟喹、磷酸咯萘啶、哌喹等；第二、殺滅紅細(xì)胞內(nèi)瘧原蟲配子體和肝細(xì)胞內(nèi)遲發(fā)型子孢子的藥物，可防止瘧疾的傳播易復(fù)發(fā)，主要包括磷酸伯氨喹和萘酚喹。