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診斷腦炎是要綜合的判斷，首先要看是否有腦炎的臨床表現(xiàn)，如發(fā)熱、頭疼、惡心、嘔吐、抽風(fēng)、精神異常，個(gè)別病人還會(huì)有局灶性肢體無(wú)力的體征。其次要做頭顱的影像學(xué)檢查，看顱內(nèi)是否有腦炎相關(guān)的病灶，像病毒性腦炎常侵犯顳葉的皮層。然后要做腰穿檢查，腰穿對(duì)于診斷腦炎非常的重要，它可以測(cè)腦脊液的壓力，看腦脊液的細(xì)胞數(shù)是否增高、蛋白是否增高。
此外還可以做腦脊液的一些病原菌的檢查，如可以做結(jié)核檢查或者墨汁染色查真菌。還可以用PCR的方法檢測(cè)一些病毒，因此腦炎的診斷是綜合的一種診斷。