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手足口病疫苗主要是針對腸道病毒EV71型引起的手足口病所制成的滅活疫苗，對于由EV71病毒感染引起的手足口病，保護(hù)效率可以高達(dá)90%以上，可以有效的降低EV71病毒引起的手足口病的發(fā)病率，尤其可以減少重癥的手足口病和死亡病例的發(fā)生率。
但是手足口病并不只是由EV71一種病毒感染引起的，還可以由柯薩奇病毒感染引起。所以并不等于接種過手足口病疫苗，就不會得手足口病，只能說接種過手足口病疫苗之后，不再得由EV71病毒感染引起的手足口病。