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小兒卡氏肺囊蟲肺炎的治療主要和成人的治療方案大致相同，兒童由于免疫和呼吸系統(tǒng)都沒有發(fā)育成熟，屬于一種免疫低下的狀態(tài)，特別容易被機(jī)會(huì)性致病菌感染，當(dāng)然卡氏肺孢子蟲是機(jī)會(huì)性致病菌。這個(gè)菌雖然叫囊蟲，實(shí)際上后來對(duì)基因檢測(cè)發(fā)現(xiàn)，它的基因跟真菌的基因很多都是相似的。
目前把卡氏肺囊蟲叫做耶氏肺孢子菌，疾病的治療主要是應(yīng)用磺胺抗生素來進(jìn)行治療，同時(shí)可以合并一些抗真菌的藥，比如卡泊芬凈、米卡芬凈等。由于小兒不能夠耐受大劑量藥物的治療，所以要根據(jù)孩子的體重，再乘以每千克藥的劑量之后算出相對(duì)合適的值，給予口服磺胺，再加上靜脈輸注卡泊芬凈，就會(huì)起到非常好的效果，療程一般是21天左右，基本上就可以痊愈。