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一般引起新生兒心率低的原因主要包括以下幾種情況：首先是由于患有先天性心臟病引起的，如果患有室間隔缺損、房間隔缺損，或者法洛氏四聯癥等先天性心臟病以后，常常會出現心率過低，并且有些會引起口唇的青紫等癥狀。
針對這種情況可以做心臟彩超及時確診。其次是由于先天性甲狀腺功能減退癥引起的，如果新生兒患有先天性甲狀腺功能減退癥，常常會出現心率比較低，并且呼吸次數也偏低，胃腸蠕動也是慢的。
這主要是由于甲狀腺功能是導致新陳代謝率加快，如果甲狀腺功能降低以后會引起代謝率的降低，從而引起心跳、呼吸的過慢，針對這種情況可以給新生兒及時應用甲狀腺素片。