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亞臨床甲減與甲減的發(fā)病原因一樣，亞臨床甲減最常見的病因是以下幾點：
第一、自身免疫性甲狀腺炎，包括橋本甲狀腺炎、萎縮性甲狀腺炎等。
第二、甲狀腺破壞，包括手術(shù)、碘-131、頸部放療后，均可以導(dǎo)致亞臨床甲減。
第三、藥物，比如碘過量可以導(dǎo)致甲狀腺過氧化物酶抗體，以及甲狀腺球蛋白抗體陽性的患者發(fā)生甲減。含碘的藥物主要是胺碘酮，誘發(fā)甲減的發(fā)生率是5%-22%，其它的藥物比如抗甲狀腺藥物，也可以阻斷甲狀腺激素的合成，鋰鹽也可以阻斷激素的合成和釋放。
第四、先天性甲狀腺缺如或者異位，也可以導(dǎo)致甲減。