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庫欣綜合征主要的病因是發(fā)生在，下丘腦-垂體-腎上腺這個功能軸調控失常了。腎上腺皮質分泌過量的糖皮質激素，導致一系列的臨床表現(xiàn)。最常見的一個是發(fā)生在垂體和下丘腦，另外也有發(fā)生在腎上腺本身的疾病。發(fā)生在下丘腦和垂體，主要是由于這些部位長了腫瘤或者增生，分泌很多的指揮腎上腺的激素，造成腎上腺整個的彌漫增生，從而腎上腺過量的分泌糖皮質激素，導致全身各個系統(tǒng)都有表現(xiàn)。過量的垂體或下丘腦，激素主要來源于下丘腦和垂體的腫瘤。
另外有一部分病變是發(fā)生在腎上腺本身，腎上腺腫瘤或增生，分泌過量的糖皮質激素造成庫欣綜合征。還有一部分病變沒有發(fā)生在腎上腺和垂體和下丘腦，而是發(fā)生在身體其他的部位，像肺或者是肝、胰腺，可以分泌有一種類似下丘腦和垂體分泌的促腎上腺皮質激素，也可以刺激腎上腺過量的分泌糖皮質激素，引起庫欣綜合征。