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由于核磁共振利用的是體內(nèi)的氫原子核在外加磁場作用下運動，從而成像的一種影像學(xué)檢查方式。所以對人體是沒有輻射的，而且到目前為止，世界上也沒有發(fā)現(xiàn)核磁共振對人體有副作用的報道。
但是由于磁共振的檢查空間相對比較密閉，所以患者在做檢查的過程中容易有恐懼心理，會使心率加快，但是都是短暫的，一般檢查之后會緩解，有極個別患者有幽閉恐懼癥的不能夠做此項檢查。
另外核磁共振在檢查時噪音比較大，有部分患者可能會出現(xiàn)耳部不適，檢查后一段時間也會消失，個別較敏感的患者也可以在檢查前使用耳塞塞住耳朵。