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肺炎支原體可以引起呼吸道感染，造成呼吸道和肺部的急性炎癥性改變，同時(shí)有咽炎、支氣管炎和肺炎。本病潛伏期2-3周，通常起病比較緩慢，常以上呼吸道感染起病，約1/3病例沒有癥狀，有些病例進(jìn)而發(fā)生氣管支氣管炎和肺炎。發(fā)病初期有乏力、頭痛、咽痛、畏寒、發(fā)熱、肌肉酸痛、食欲減退、惡心、嘔吐等，熱度高低不一，可高達(dá)39℃，2-3天后出現(xiàn)明顯的呼吸道癥狀，如陣發(fā)性刺激性咳嗽、干咳或少量黏痰，或黏液膿性痰，有時(shí)痰中帶血，咳嗽劇烈者長束胸骨后，即兩肋部疼痛，多持續(xù)數(shù)周，方見緩解。
發(fā)熱可持續(xù)2-3周，體溫恢復(fù)正常后可能仍有咳嗽、食欲不振、惡心、嘔吐、腹瀉等，并不少見，但程度較輕。少數(shù)病人可以有關(guān)節(jié)痛和關(guān)節(jié)炎或者皮膚損害，兒童常有耳痛及大皰性鼓膜炎，成人則以鼻旁竇炎為常見并發(fā)癥。病情一般輕微，有時(shí)也可以相當(dāng)嚴(yán)重，可有肺膿腫、氣胸、COPD急性加重、支氣管擴(kuò)張、閉塞性細(xì)支氣管炎甚至并發(fā)ARDS、BIC。極少數(shù)病例可伴發(fā)中樞神經(jīng)癥狀，例如腦膜炎、腦膜腦炎、多發(fā)性神經(jīng)根炎甚至發(fā)生精神失常等。