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氨基酸代謝異常部分病人可以進行治療，但一定要查明病因后對癥施治，對于該病癥可以選用飲食療法、藥物療法兩種療法。
氨基酸代謝異常主要分為兩類，一類是是由于酶缺陷而導致的病癥，另一類是由于人體氨基酸吸收轉運系統(tǒng)缺陷。
藥物治療首先可以選擇補充大劑量的維生素B6、維生素B1等，并讓孩子平時多吃水果、蔬菜，補充身體內所缺乏的微量元素和礦物質來增強抵抗力。
其次對于由于氨基酸代謝異常而引起抽搐的兒童，需要在醫(yī)生的幫助下使用抗癲癇的藥物進行治療。
另外對于無明顯癥狀的兒童，則不需要進行特殊治療，只要平時注意飲食即可，避免亂用藥物影響孩子身體發(fā)育。