新生兒腸炎分為感染性腸炎和非感染性腸炎，感染性腸炎的治療主要是給予預(yù)防脫水、治療脫水、合理用藥、繼續(xù)飲食的治療原則，輕癥的患兒可以減少喂奶次數(shù)和喂奶量。如果有明顯的腹脹、嘔吐的患兒可以禁食4-6個小時，但禁食不益過長。如果新生兒有脫水，給予補(bǔ)液治療，進(jìn)行靜脈輸液補(bǔ)液治療，脫水可分為輕度、中度和重度，根據(jù)其脫水的程度給予補(bǔ)液。
還應(yīng)該控制感染，70%左右的水樣便可能是病毒感染導(dǎo)致，不需要用抗生素治療。有一部分細(xì)菌性痢疾、沙門菌等需要抗感染治療，抗感染治療需要根據(jù)糞便培養(yǎng)、藥敏的結(jié)果進(jìn)行治療，還可以用應(yīng)用雙歧桿菌調(diào)節(jié)腸道的菌群，建立腸道的保護(hù)屏障，還可以口服思密達(dá)，保護(hù)胃腸道黏膜，減輕腹瀉。
還有一些是非感染疾病導(dǎo)致的腹瀉，例如乳糖不耐受，還有是牛奶蛋白過敏等情況。乳糖不耐受導(dǎo)致的腹瀉，可以給予口服乳糖酶，或者更換為無乳糖配方的奶粉喂養(yǎng)，牛奶蛋白過敏應(yīng)該給予更換氨基酸奶粉、深度水解蛋白奶粉喂養(yǎng)。如果有脫水需要給予脫水補(bǔ)液治療，并且腸道黏膜保護(hù)劑、益生菌治療等。
