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胃蛋白酶原是用于篩查患者是否存在萎縮的一種胃特異性生化標(biāo)志物，主要分為胃蛋白酶原Ⅰ跟胃蛋白酶原Ⅱ。胃蛋白酶原Ⅰ是由胃底跟胃體的泌酸腺分泌，而胃蛋白酶原Ⅱ是由所有的胃腺分泌，在檢查的意義中，胃蛋白酶原Ⅱ單獨(dú)的偏高意義并不大，而是觀察胃蛋白酶原Ⅰ以及胃蛋白酶原Ⅰ與Ⅱ的比值是否明顯下降。
如果胃蛋白酶原Ⅰ的水平降低，以及二者的比值明顯下降，它與廣泛性的腸上皮化生以及與萎縮胃的萎縮密切相關(guān)，它與自身免疫性的胃炎是否存在惡性貧血也密切相關(guān)。如果比值降低或者胃蛋白酶原Ⅰ降低，說(shuō)明胃的萎縮的范圍已經(jīng)累及到了胃體或胃底，在這種情況下發(fā)生胃癌的幾率就會(huì)明顯的增高。所以單純的胃蛋白酶原Ⅱ偏高意義不太大，更多關(guān)注的是胃蛋白酶原Ⅰ以及二者的比值。