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艾滋病窗口期的病因主要是病毒感染，是指通過傳播途徑感染艾滋病病毒，具體如下：
1、性接觸傳播，多性伴行為、安全防護(hù)措施不到位、嫖娼，以及與艾滋病感染者或艾滋病患者發(fā)生無保護(hù)的性行為。
2、血液和體液傳播，輸用還有艾滋病病毒的血液，或破損傷口接觸含有艾滋病病毒的血液、體液，有吸毒經(jīng)歷，并與艾滋病患者或艾滋病感染者共用注射針頭等。
3、母嬰垂直傳播，HIV病毒感染的孕婦可以將病毒傳播給孩子。
部分感染者在窗口期還會(huì)出現(xiàn)一些臨床癥狀，是由艾滋病病毒血癥和免疫系統(tǒng)急性損傷所導(dǎo)致的，大多數(shù)感染者表現(xiàn)比較輕微，持續(xù)1-3周后可自行緩解。臨床表現(xiàn)以發(fā)熱最為常見，同時(shí)伴有全身不適、頭痛、頭暈、盜汗、惡心、嘔吐、腹痛、腹瀉、咽喉痛、肌肉痛、關(guān)節(jié)痛、皮疹、淋巴結(jié)腫大等。這些癥狀沒有任何特異性和指向性，不能作為艾滋病的診斷依據(jù)。在發(fā)生艾滋病高危接觸后，想要確定機(jī)體是否被病毒感染，必須通過實(shí)驗(yàn)室艾滋病檢測(cè)才能夠確定。