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核磁共振可以檢查出全身很多疾病，比如做頭部的核磁共振檢查可以判斷患者是否有先天性的發(fā)育畸形，是否有腦血管的病變，比如腦出血、腦梗塞、蛛網(wǎng)膜下腔出血、顱內(nèi)的動靜脈畸形等，在還可以檢查顱內(nèi)是否有占位性病變以及感染性病變。
在做脊柱的核磁共振檢查時可以判斷頸椎、腰椎等是否有椎間盤的突出，是否有神經(jīng)和血管的受壓，是否有脊髓的占位性病變等。在做腹部臟器的檢查時可以判斷腹部的占位性病變以及炎癥性病變，在做骨骼系統(tǒng)的檢查時可以判斷肌肉、脂肪、血管、神經(jīng)等軟組織病變的情況。此外核磁共振還可以用于檢查小器官以及血管，還適合于孕中晚期胎兒的檢查。