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目前核磁共振作為臨床上最常用的輔助檢查之一，可以檢查很多的疾病，如肝臟、膽囊、胰腺、脾臟、雙腎、雙側(cè)腎上腺等，各種腫瘤、囊腫、先天性疾病等都可以進(jìn)行核磁共振檢查。子宮占位、卵巢占位、囊腫等都可以進(jìn)行核磁共振檢查。
甲狀腺、前列腺、腦部血管、心臟的大血管、四肢血管也可以進(jìn)行核磁共振檢查。各種骨科疾病也可以進(jìn)行核磁共振檢查，現(xiàn)在妊娠也可以進(jìn)行胎兒的腦部、發(fā)育檢查，以及胎盤位置、是否與宮壁粘連等都可以進(jìn)行核磁共振檢查。建議根據(jù)自己的病情選擇不同部位的檢查，一般核磁共振檢查需要提前預(yù)約。