通常全飛秒激光是比半飛秒激光更安全的治療近視眼手術(shù)，在臨床上應(yīng)用全飛秒激光，也是目前更為新興的治療近視眼方法。全飛秒激光手術(shù)是通過(guò)飛秒激光，在角膜內(nèi)磨制一個(gè)鏡片，然后通過(guò)只有2mm的切口，將鏡片取出，相當(dāng)于把眼鏡片裝到角膜上。切口較小不易發(fā)生感染，且不損傷角膜上皮神經(jīng)，因此安全性較高，術(shù)后發(fā)生干眼和其他并發(fā)癥的幾率也較低。同時(shí)全飛秒激光還可使術(shù)后的視覺(jué)質(zhì)量，得到進(jìn)一步的提升。
而半飛秒激光是通過(guò)飛秒激光切削一個(gè)角膜瓣，然后在角膜瓣下通過(guò)準(zhǔn)分子激光，磨削度數(shù)，手術(shù)后再將角膜瓣覆蓋回去。由于相對(duì)切口比較大，并且切削到角膜神經(jīng)，因此無(wú)論是術(shù)后干眼還是感染的發(fā)生率，通常都相對(duì)偏高。
