直腸炎一般吃藥多長時間，主要根據(jù)直腸炎治愈的程度來判定。直腸炎的治愈需要結(jié)合中醫(yī)證候療效評價標準，評價標準中療效指數(shù)大于95%，要結(jié)合常見的療效評價。常見的療效評價包括內(nèi)鏡應(yīng)答和黏膜愈合來進行評價。
在黏膜愈合評價中，一般參考吉布斯指數(shù)描述來評價，因為吉布斯指數(shù)描述可重復性比較好，黏膜組織學評分效度也比較高，比較理想的腸炎組織學評分指數(shù)，目前廣泛應(yīng)用臨床試驗，為療效評估的終點指標之一。
一般臨床癥狀都比較緩解，腸鏡下黏膜也愈合了，但不代表腸炎治愈，只是癥狀緩解，建議堅持吃藥大約3年左右。
