根尖囊腫手術(shù)后出現(xiàn)疼痛等輕微不適，通常是正常情況，隨著時間會慢慢減輕。如果根尖囊腫術(shù)后疼痛明顯，尤其是術(shù)后過了3-4天，感覺術(shù)區(qū)脹痛，甚至出現(xiàn)黃色分泌物，需考慮術(shù)區(qū)有積液，并且積液出現(xiàn)感染。這種情況可能要局部打麻藥，進行清創(chuàng)、沖洗，去除感染組織。必要時填塞碘仿紗條，配合口服消炎藥，控制炎癥。
如果囊腔較大，在打麻藥清創(chuàng)后，可以教會患者每天進行局部的沖洗，早、中、晚共3次，直到囊腔逐步長好。只要囊腔保持通暢里的積液能夠流出，通常炎癥控制較好，則不會有明顯疼痛。
