兒童布地奈德的副作用較明顯，因為布地奈德屬于腎上腺糖皮質激素，可損傷局部免疫力。布地奈德出通常采用霧化吸入，雖然也可以局部涂抹，但兒童通常會采用霧化吸入的方式，可以使霧化過程中的通道，如口腔、鼻腔、呼吸道的免疫功能下降。
因為人的口腔、鼻腔、呼吸道，都有局部免疫反應，都有局部的分泌型IgA的出現(xiàn)。因為布地奈德具有抗炎功效，可能會抑制分泌型IgA的產出，影響到局部免疫功能。所以兒童經常做布地奈德霧化，易出現(xiàn)鵝口瘡以及口腔霉菌的感染，嚴重時可以出現(xiàn)呼吸道深部的真菌感染。所以小兒布地奈德雖然對治療喘息的治療效果較好，可以治療較多疾病，而且全身的副作用比較輕，但存在局部副作用。所以建議在有指征的情況下，充分評估可能帶來的副作用，然后應用小兒布地奈德。
