纖維支氣管鏡的適應癥有很多，在兒科，最常見的適應癥有：
1、慢性刺激性咳嗽，針對慢性刺激性咳嗽做支氣管鏡的目的主要是進一步的明確診斷；
2、局限性的喘鳴，一般出現局限性喘鳴多半可能存在有局部氣道不通暢，可以通過支氣管鏡了解氣道不通暢的相關的原因；
3、針對肺不張或者是阻塞性肺氣腫的患兒，可以通過支氣管鏡進一步明確診斷，也可以通過支氣管鏡來吸引出引起肺不張的黏稠痰液，而起到治療作用；
4、支氣管肺部炎癥的病原學檢查和治療，對難治性的肺部感染，可以通過支氣管鏡留取生物標本，做病原學檢查，同時也可以局部給藥促進肺部炎癥的好轉；
5、咯血或者是痰中帶血的診斷和治療；
6、對局限性或者是彌漫性肺部的陰影的診斷和鑒別診斷；
7、可以在支氣管鏡引導下進行氣管插管；
8、在外科手術特別是胸外科手術之前，可能需要行支氣管鏡檢查，通過支氣管鏡了解氣道有無畸形。
