臨床上抗病毒眼藥水有阿昔洛韋、更昔洛韋，這兩種眼藥水在臨床工作中可以治療大多數(shù)病毒感染帶來的眼部疾病，常見的是病毒性結(jié)膜炎、病毒性角膜炎。
如果眼部疾病使用阿昔洛韋和更昔洛韋抗病毒效果不好，可以通過全身給藥進行輔助治療，比如可以口服抗病毒藥物，如病毒唑、阿昔洛韋、更昔洛韋，或者可以脊柱給藥、靜脈給藥，可以輔助治療眼部病毒性感染引起的疾病。
近年來還有更多抗病毒眼藥水在研制，如無環(huán)鳥苷滴眼液和眼膏，還有含魚腥草成分的中藥，中藥成分抗病毒作用的眼藥水成分比較復雜，有些病人可能會有過敏反應，用了眼藥水之后眼睛更癢，應該立即停止使用，到眼科確診原因。
