胃腸外科主要針對(duì)胃腸道需要手術(shù)治療的病變，包括常見(jiàn)的胃腸道腫瘤，如胃癌、結(jié)腸癌，或者其他的惡性或者良性腫瘤，如間質(zhì)瘤、平滑肌瘤，可能只要需要手術(shù)治療的都需要胃腸外科進(jìn)行治療。
另外現(xiàn)在針對(duì)部分良性疾病，胃腸外科也可以進(jìn)行治療，比如減重手術(shù)，也在胃腸外科進(jìn)行，胃食管反流需要進(jìn)行抗反流手術(shù)，也是在胃腸外科進(jìn)行手術(shù)。所以主要針對(duì)胃腸道，只要需要外科進(jìn)行治療，需要進(jìn)行手術(shù)治療的疾病，都是在胃腸外科進(jìn)行治療。
胃腸外科除了管胃和大腸以外，小腸也都屬于胃腸外科治療的范疇，小腸疾病相對(duì)比較少見(jiàn)，如間質(zhì)瘤、小腸惡性腫瘤，還有部分需要治療的疾病，如梅克爾憩室等都需要胃腸外科進(jìn)行診治。
胃腸外科和內(nèi)科的主要區(qū)別在于胃腸外科主要是開(kāi)腹或者腹腔鏡下進(jìn)行手術(shù)，內(nèi)科主要是在藥物治療，或者是進(jìn)行內(nèi)鏡下的手術(shù)治療，這就是胃腸外科和胃腸內(nèi)科的主要區(qū)別。
