廣義上的膽結石包括膽囊結石和膽管結石，膽管結石又包括肝內膽管結石和肝外膽管結石，膽囊結石只是膽結石一種類型。膽囊結石和膽管結石成分不同，膽囊結石主要是膽固醇結石和以膽固醇為主的混合性結石，膽管結石主要是膽色素結石，但臨床上膽囊結石可能掉到膽管，此時膽管結石可以與膽囊結石性質相同。臨床上可出現單純膽囊結石，還可出現膽囊結石合并膽管結石。
此外，相對于膽管結石，膽囊結石處理更簡單，只需在腹腔鏡下把膽囊切除即可。膽管結石的處理則較為復雜，尤其是肝內膽管結石，可能需要同時切除病變肝臟，甚至可能需要多次手術處理。
