皮脂腺囊腫的手術(shù)通常是在局部麻醉下進(jìn)行，手術(shù)時(shí)會(huì)在皮脂腺囊腫的周圍，浸潤注射局部麻醉藥物。臨床上比較常用的局部麻醉藥物是利多卡因，注射后即刻起效，達(dá)到手術(shù)區(qū)域沒有疼痛的目的。但是在過程當(dāng)中患者始終清醒，可以和醫(yī)生進(jìn)行溝通。在皮脂腺囊腫的表面皮膚上，往往可以找到針尖樣的開口。所以在設(shè)計(jì)手術(shù)切口時(shí)，會(huì)以開口為中心，順著皮膚紋理的方向設(shè)計(jì)梭形的切口，沿著切口從皮膚開始一直切到皮脂腺囊腫的包膜外。在見到包膜后，在包膜外面進(jìn)行仔細(xì)的分離，最終將皮脂腺囊腫包膜，連同表面只有一條梭形的皮膚完整的切除。
皮脂腺囊腫在切除之后，局部往往會(huì)遺留潛在的腔隙。如果腔隙比較大，手術(shù)醫(yī)生會(huì)放置引流條。引流條的作用是 將腔隙當(dāng)中的滲血、滲液及時(shí)的引流到傷口外面，預(yù)防在深部堆積影響傷口的愈合，引流條通常需要在術(shù)后24小時(shí)左右拔除。手術(shù)切口最后會(huì)進(jìn)行分層次的縫合，達(dá)到比較好的美觀效果。
