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正常人的糞便中含有大量的細(xì)菌，糞便標(biāo)本檢驗(yàn)必須是從混有大量正常菌的菌群中選出病原菌，此時(shí)則需注意糞便的正確采集和運(yùn)送，以提高檢查的陽性率。
常規(guī)檢測(cè)的病原菌，包括沙門菌、志賀菌、彎曲菌，對(duì)于濱海城市的實(shí)驗(yàn)室，還應(yīng)檢查氣單胞菌和弧菌，對(duì)于血性糞便注意分離O157型的細(xì)菌。除以上細(xì)菌，通過大便培養(yǎng)可以分離到的病原菌，還有小腸結(jié)腸炎耶爾森氏菌、鄰單胞菌、致病性大腸桿菌、遲緩愛德華菌、蠟樣芽孢桿菌、艱難梭菌、葡萄球菌、產(chǎn)酸克雷伯桿菌等；真菌的培養(yǎng)，少量的真菌孢子存在于糞便內(nèi)，但是真菌性腹瀉多繼發(fā)于抗生素治療后的菌群失調(diào)，多為白色念珠菌。
細(xì)菌類型不同，選取的培養(yǎng)基也不同，如急性腹瀉，接種于SS和麥康凱平板，35℃培養(yǎng)18-24小時(shí)；致病性的埃希菌，可以使用中國藍(lán)平板35℃培養(yǎng)18-24小時(shí)；霍亂弧菌及副溶血弧菌，取1mL水樣便接種于堿性蛋白胨水中，35℃培養(yǎng)4-6個(gè)小時(shí)后，取菌膜或者培養(yǎng)液接種于TCBS平板35℃條件培養(yǎng)24-48小時(shí)即可。