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萎縮性胃炎是否嚴(yán)重，不能一概而論，與非萎縮性胃炎如淺表性胃炎相比，相對較為嚴(yán)重，但與癌前病變?nèi)缒c化生、異型增生，以及胃癌相比，則嚴(yán)重程度較低。對于慢性萎縮性胃炎，根據(jù)發(fā)生萎縮的部位不同，嚴(yán)重程度也不完全相同，如發(fā)生在胃竇部的萎縮往往因長期幽門螺桿菌感染未根除，出現(xiàn)胃竇部幽門腺減少，稱為胃竇部萎縮性炎癥，治療效果較好，可通過藥物逆轉(zhuǎn)萎縮。

而胃體部萎縮主要是胃體腺體減少，表現(xiàn)為低胃酸狀態(tài)，患者壁細(xì)胞減少，導(dǎo)致酸分泌減少，進(jìn)而呈低胃酸狀態(tài)，出現(xiàn)消化不良及葉酸、維生素B₁₂吸收缺乏，可能會出現(xiàn)惡性貧血。胃體萎縮性胃炎往往與免疫狀態(tài)有關(guān)，患者可能會出現(xiàn)免疫紊亂，屬于免疫系統(tǒng)疾病，與遺傳有一定關(guān)系，治療上比胃竇部萎縮性胃炎更困難，同時更為嚴(yán)重。