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腸鏡分為十二指腸鏡、小腸鏡、膠囊內鏡、結腸鏡，根據腸鏡檢查的類型不同，檢查的通路不同，具體如下：

1、小腸鏡：小腸鏡需進行2次檢查，從肛側做1次，從口側做1次，而后在小腸中部交匯，才能將5-7米長的小腸完全觀察，是從口腔入鏡，因為小腸鏡是側視鏡，所以沒辦法詳細觀察食道和胃。小腸鏡進入十二指腸以后主要觀察十二指腸乳頭，并進行膽道穿刺造影、取石，甚至放置支架等治療；

2、結腸鏡：從肛側檢查，結腸鏡首先需進行腸道的清潔準備，將腸腔結腸內的宿便清干凈。其次從肛側插進內鏡，先送到回盲部，觀察回盲部和闌尾，再向內推進逐漸進行觀察；

3、膠囊內鏡：小膠囊內鏡通過口服，進入胃腸道后進行拍照和觀察，能解決十二指腸鏡痛苦的問題。但是膠囊內鏡不能取活檢，只能是觀察可疑病變，而且有膠囊滯留的風險。