角膜炎的治療原則是積極地控制感染，減輕炎癥反應，促進潰瘍的愈合，減少疤痕的形成。針對不同致病菌引起的角膜炎，用藥也不一樣。
1、細菌性角膜炎：對于細菌性角膜炎，臨床上要采用廣譜的抗生素類眼藥水局部點眼，如左氧氟沙星、托百士(妥布霉素滴眼液)等；
2、真菌性角膜炎：對于真菌性角膜炎，要選擇抗真菌的藥物局部點眼。但是目前臨床上缺乏高效、低毒的廣譜抗菌藥物，所以一般的用藥原則是聯(lián)合用藥來提高這種療效。對于病情嚴重的患者，可全身給予抗真菌藥物進行治療；
3、單皰病毒性的角膜炎：單皰病毒性的角膜炎即單純皰疹病毒性的角膜炎，一般是用抗病毒類的滴眼液進行治療，如更昔洛韋眼用凝膠或者是阿昔洛韋滴眼液，也可以配合干擾素來提高療效。
糖皮質激素在角膜炎的治療過程中，一定要謹慎掌握適應證，因為糖皮質激素如果使用不當，會加重角膜炎引起角膜潰瘍，有時甚至會引起角膜的穿孔。
在細菌性角膜炎的急性期禁用糖皮質激素，一般到慢性愈合期可以酌情使用糖皮質激素，來恢復角膜的透明性。真菌性角膜炎在全程的治療過程中都要禁用糖皮質激素，單純皰疹性病毒性的角膜炎，一般上皮型的角膜炎禁用激素，對于基質型或者是內皮型的角膜炎，可以酌情使用激素類滴眼液進行治療。
