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引起胚胎停育的原因很多，包括男方因素、女方因素、胚胎因素，其中最重要因素是胚胎本身因素。精子和卵子受精之后，精子、卵子本身如果存在問題，或者受精卵出現(xiàn)基因、染色體問題，則會(huì)導(dǎo)致胚胎停止發(fā)育。胚胎停止發(fā)育本身并不是壞事，因?yàn)槿绻咛ベ|(zhì)量出現(xiàn)問題，說明其不符合優(yōu)生優(yōu)育的原則，胚胎停育本身是淘汰劣質(zhì)胚胎的自然過程。

除胚胎本身因素之外，男方精子質(zhì)量會(huì)受到遺傳性因素的影響，從而會(huì)引起精子的DNA物質(zhì)發(fā)生問題。還有男性周圍的環(huán)境因素，比如環(huán)境毒物，吸煙和飲酒，也是很大的影響因素，會(huì)對(duì)精子質(zhì)量產(chǎn)生很大影響。此外，女性生殖道畸形、生殖道感染、生殖道腫瘤，還有凝血功能問題以及免疫性疾病、甲狀腺疾病，均可能會(huì)對(duì)胚胎產(chǎn)生影響，同樣為發(fā)生胚胎停育的重要原因。