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泮托拉唑和奧美拉唑都屬于抑制胃酸分泌的藥物，屬于同一大類別的藥物，在化學(xué)結(jié)構(gòu)和藥理學(xué)作用上基本相同。但是這兩種藥物也有所差別，具體如下：

1、化學(xué)結(jié)構(gòu)：泮托拉唑與奧美拉唑的部分化學(xué)結(jié)構(gòu)可能會(huì)有所差異，雖然兩者對胃酸作用的效果基本相似，但是也有研究表明，可能泮托拉唑的抑酸效果略強(qiáng)于奧美拉唑；

2、藥物代謝：泮托拉唑代謝一般不受細(xì)胞色素p450酶的影響，同時(shí)也不會(huì)影響其他藥物經(jīng)過這個(gè)酶的代謝。但是奧美拉唑的代謝過程可能會(huì)受到更多的這個(gè)酶的影響，另外奧美拉唑也可能會(huì)容易影響其他藥物的代謝。比如心血管患者常用的氯吡格雷可能會(huì)和奧美拉唑有藥物相互作用。泮托拉唑發(fā)生藥物相互作用的幾率更少，而奧美拉唑相對容易發(fā)生藥物相互作用。

總之，泮托拉唑和奧美拉唑都屬于抑制胃酸分泌的藥物，這兩者在藥物代謝方面具有一定的差別。