甲胎蛋白高的原因也比較多，如懷孕、畸胎瘤，或者是肝細胞肝癌，或者是肝炎的活動期，都會引起升高。但如果排除這些疾病，之前有慢性肝炎的病史，甲胎蛋白也會明顯升高。
甲胎蛋白一般不能超過20ng/ml或者不能超過40ng/ml，指標超過200ng/ml或超過400ng/ml，通過B超檢查也有肝臟內的病變，肝細胞肝癌的概率就明顯增加。但是也需要排除上述有可能甲胎蛋白升高的原因，肝炎活動期、肝炎病毒的復制量有明顯增高的時候，甲胎蛋白的量也會超過上述的200ng/ml或者400ng/ml。
這種情況下不僅要查甲胎蛋白，還需要查腫瘤標志物，也會需要查B超或者是強化CT或磁共振，進一步明確病變的性質。如果要是單純甲胎蛋白升高，但是強化CT或磁共振，或者是介入的治療檢查的方法沒有確定肝臟病變的性質，還得在短期內隨訪觀察，在抗病毒治療的同時，觀察甲胎蛋白是否有逐漸下降的趨勢。如果抗病毒效果有效，甲胎蛋白也出現(xiàn)下降，也可以排除腫瘤的可能，考慮是肝炎的活動期。
