任何手術都存在一定風險，椎間孔鏡手術同樣如此，其風險主要體現在以下方面：
1、麻醉風險：椎間孔鏡手術有兩個入路，從背側入路時，可做全麻，也可局部腰麻，通常選擇局部麻醉，不同麻醉的風險不同，即使是最簡單、最安全的局麻也存在麻藥過敏的風險；
2、損傷神經：通常椎間盤摘除手術都涉及神經，摘除和暴露椎間盤的過程，以及椎管減壓過程中，可能會造成神經受損；
3、感染風險；手術過程中會造成切口，微創(chuàng)手術也存在感染的可能，椎間孔鏡手術從皮膚入路，經過肌肉組織到骨性孔道，最后到達椎管內，此過程中，每個層次均存在感染的風險，但相對開放手術，其風險較低。
