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幽門螺桿菌檢測(cè)方法非常多，大體分為侵入性和非侵入性檢查。臨床上進(jìn)行普查或者病人在門診進(jìn)行的廣泛的篩查是尿素呼氣試驗(yàn)，有碳13呼氣試驗(yàn)和碳14呼氣試驗(yàn)兩種。首先病人空腹，然后先吹一口氣，給病人吃一粒同位素尿素，可以含碳13或者碳14，過半個(gè)小時(shí)再呼一次氣，測(cè)量同位素的碳濃度，給出準(zhǔn)確數(shù)值，而且也是指導(dǎo)臨床治療療程和治療以后復(fù)查隨訪的方式。

還有一部分條件有限，可以抽血查幽門螺桿菌抗體，但是不管是遠(yuǎn)期感染還是現(xiàn)癥感染，抗體都可以表現(xiàn)為陽性，所以不能用于指導(dǎo)治療的方式，還是需要進(jìn)行呼氣試驗(yàn)；應(yīng)用的比較多的檢查是做胃鏡的時(shí)候，在胃竇附近幽門5cm范圍內(nèi)的位置取一小塊標(biāo)本，然后做快速尿素酶試驗(yàn)，既可定位也可定性，能夠根據(jù)變色程度不同，給出感染嚴(yán)重程度的差別。

在做胃鏡的時(shí)候會(huì)根據(jù)病情取得活檢，有時(shí)候在顯微鏡下能夠看到幽門螺桿菌，稱為病理活組織檢查。科研方面可能刻意的去捕捉細(xì)菌，但是臨床在正常胃鏡下，不會(huì)常規(guī)取病理活組織尋找幽門螺桿菌。