顱腦超聲主要是檢查顱腦器質性病變，無法檢查功能性病變，包括早產兒的常規(guī)篩查、新生兒窒息、新生兒缺血缺氧性腦病、顱內出血、顱內感染、顱內占位性病變以及腦積水等。由于超聲波的特性限制，骨骼內以及其后方病變不能顯示，小兒因為囟門沒有閉合，沒有顱骨遮擋，故可以作為透聲窗檢查腦部結構。
隨著醫(yī)療水平提高，早產兒、低體重新生兒的存活率有所增加，但是各類腦損傷造成的小兒腦癱會影響生活質量。顱腦超聲可以早期診斷小兒腦損傷，并可以動態(tài)觀察各類腦損傷不同階段的聲像圖特點，用來指導臨床治療，盡管CT和磁共振等影像學發(fā)展迅速，但是超聲無創(chuàng)、便捷以及可以進行床旁檢查，對高危兒童疾病診斷具有重要性，是首選的檢查方法。
成人顱腦超聲檢查主要是術中檢查，成人囟門已經閉合，沒有透聲窗，成人超聲檢查主要是進行顱內腫瘤、感染、血管性疾病定位以及確定邊界等，了解腦腫瘤血流動力學信息，了解腦腫瘤周圍有沒有重要血管，識別顱內動脈畸形、供血動脈和引流靜脈等。
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