因?yàn)榧?xì)菌可以在外環(huán)境中，也可以寄生在體表或者各種腔道，比如腸道、陰道，以及泌尿系統(tǒng)，還有口腔，可能都含有細(xì)菌。這些細(xì)菌如果打破了局部免疫屏障或者出現(xiàn)在腸道，或者其他寄生部位的菌群紊亂、局部的皮膚黏膜免疫屏障功能被打破，都有可能會(huì)引起細(xì)菌感染。
細(xì)菌的感染可以是外源性，也可以是內(nèi)源性，比如呼吸道感染，是引起細(xì)菌感染最多見(jiàn)的感染部位。呼吸道黏膜如果在受涼、受寒、淋雨、疲勞的情況下，可能會(huì)引起局部的免疫功能下降，局部的免疫球蛋白會(huì)減少，吞噬功能會(huì)下降。另外，呼吸道的纖毛系統(tǒng)會(huì)出現(xiàn)運(yùn)動(dòng)功能的障礙，如果有外來(lái)入侵的病原微生物，不能夠及時(shí)被清除，這時(shí)就可以引起感染。
對(duì)于表皮，如果皮膚黏膜有破損，寄生在表皮的表皮葡萄球菌以及大腸桿菌等，就可以引起皮膚黏膜感染。對(duì)于腸道，如果出現(xiàn)了正常菌群紊亂，沒(méi)有被殺死的耐藥細(xì)菌，就有可能過(guò)度生長(zhǎng)而引起疾病。如果異位到其他部位，也可能會(huì)引起感染。此外，食物如果被細(xì)菌污染，進(jìn)入到消化系統(tǒng)之內(nèi)，也會(huì)引起胃腸道的感染。
所以，一般細(xì)菌的感染，主要是由于抵抗力下降，一方面接觸外源性細(xì)菌引起感染。另一方面是內(nèi)在的細(xì)菌，可以在免疫功能低下時(shí)乘虛而入引起感染。
