胃底間質(zhì)瘤根據(jù)大小可以選擇不同的治療方法，現(xiàn)在對于2cm以下的胃間質(zhì)瘤，可以通過內(nèi)鏡的方法切除，切除以后根據(jù)病理類型決定是否是需要后續(xù)的藥物治療，一般情況下＜2cm的胃間質(zhì)瘤是低危險度的胃間質(zhì)瘤；如果病人間質(zhì)瘤＞2cm的間質(zhì)瘤，可以采取手術(shù)方法，手術(shù)的方法把胃間質(zhì)瘤切除以后，根據(jù)病理類型選擇不同的治療方法。如果是低危險度的間質(zhì)瘤，一般情況下做完手術(shù)或者內(nèi)鏡后不需要后續(xù)的治療；如果間質(zhì)瘤是中危險度或者是高危險度的間質(zhì)瘤要口服藥物，口服藥物加后續(xù)的輔助的防止復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移。
對于胃間質(zhì)瘤尤其是小的胃間質(zhì)瘤可以治愈；對于大的胃間質(zhì)瘤，可以在手術(shù)切除的基礎(chǔ)上輔助藥物治療。對于胃間質(zhì)瘤一般情況可以治好，因為已經(jīng)發(fā)生轉(zhuǎn)移的胃間質(zhì)瘤比較少，如果病人已經(jīng)發(fā)生多處轉(zhuǎn)移，表明病人是高危險度間質(zhì)瘤，治好的可能性不是很大。一般情況下如果是低危險度和中危險度可以治好。
