腦脊液NGS是英文縮寫,全稱是Next Generation Sequencing,是指新一代的高通測序技術(shù)。腦脊液NGS檢測是針對腦脊液進(jìn)行高通測序,確定是否存在感染的病原體,以及通過此類方法來排除感染性病原體,診斷非感染性疾病。
神經(jīng)系統(tǒng)有部分疾病和感染有關(guān),如病毒性腦膜炎、病毒性腦炎、細(xì)菌性腦膜炎,以及結(jié)核、霉菌及其他少見的病毒、細(xì)菌感染等,包括寄生蟲感染,也有相關(guān)的抗原、抗體或者核酸。
NGS是核酸檢測的一種方法,如新型冠狀病毒,用核酸檢查方法可以進(jìn)行診斷。對于腦脊液,也可以通過腦脊液的測序發(fā)現(xiàn)滴度非常低的核酸存在,從而判斷是否存在感染性的病原體。
但此過程非常敏感,有時皮膚代謝性細(xì)菌也可以被發(fā)現(xiàn)。此時會結(jié)合數(shù)據(jù)庫來鑒定是否是背景細(xì)菌感染,即正常細(xì)菌的污染,或者是特異性的細(xì)菌感染,如感染性的病原體、結(jié)核桿菌等。
腦脊液NGS檢測實際上有時候可以出現(xiàn)假陽性,就是上述原因。同時可以出現(xiàn)假陰性,如腦脊液保存不當(dāng),或者腦脊液采集有問題、感染菌滴度較低,也可以因為假陰性的存在而無法確定。