督脈灸的作用與功效主要是補陽氣。督脈是人體一身陽脈之海，所以督脈灸能夠補五臟六腑的陽氣，也可以補十二條正經的經絡陽氣，督脈灸作用于督脈上，對補充陽氣的作用會更加明顯。
督脈灸是從大椎開始，一直會灸到長強，灸的時間有的可能會半個小時，有的甚至1-2個小時都有。灸法主要是要將其灸通透，可以起到助陽散寒、溫經通絡、消炎止痛的作用。
主要用于治療頸肩腰腿痛，脊柱的相關疾病比如強直性脊柱炎、腰背肌筋膜炎、腰椎間盤突出、胸椎小關節(jié)紊亂，還有和小關節(jié)紊亂相關的比如腸易激綜合征、心臟神經官能癥、老慢支、肺氣腫，這些都可以通過督脈灸得到改善，還有婦女的宮寒，即婦女的月經不調、痛經。
