慢性結(jié)腸炎屬于統(tǒng)稱，多種原因?qū)е陆Y(jié)腸慢性炎癥都稱為慢性結(jié)腸炎。所以慢性結(jié)腸炎病因較為復(fù)雜，常見病因是一種非特異性結(jié)腸炎，例如腸易激綜合征、腸道菌群失調(diào)、小腸吸收不良。
一般認(rèn)為慢性結(jié)腸炎與感染、免疫遺傳、環(huán)境、食物過敏、防御功能屏障及精神因素有關(guān)。所以慢性結(jié)腸炎是否嚴(yán)重主要依據(jù)引起慢性結(jié)腸炎病因，需要積極尋找致病原因，對(duì)抗病原體，消除腸毒素，改善癥狀。例如慢性結(jié)腸炎是因?yàn)榫窬o張過度引起或食用不潔食物引起，需要對(duì)癥處理，積極調(diào)整情緒，避免不潔飲食，這樣防止結(jié)腸炎復(fù)發(fā)。慢性期主要以保守治療為主，爆發(fā)型或內(nèi)科療效不佳的結(jié)腸炎，可以采用外科手術(shù)治療。
