臨床上真菌性鼻竇炎分兩大類，一大類叫侵襲性鼻竇炎；另一大類叫非侵襲性鼻竇炎。治療方法分別如下：
1、非侵襲性真菌性鼻竇炎相對好，比較常見的比如真菌球，真菌球一般建議鼻內鏡手術清理干凈之后，定期復查和沖洗；如果是變異性的真菌性鼻竇炎，一般跟過敏有關，在做手術之外，還可能要增加抗過敏的治療；
2、侵襲性真菌性鼻竇炎比較兇險，因為真菌可以侵入到血管，隨著血液可能到全身各處。又分急性和慢性，不管是急性和慢性，一般建議及時的手術，清理鼻竇的真菌。同時往往在全身和局部還要給予抗真菌的藥物，才有可能得到比較好的效果。侵襲性真菌性鼻竇炎預后不是特別好，所以一定要及時治療。
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