神經源性肌萎縮治療起來較困難，包括藥物治療和一些康復治療，具體如下：
一、周圍神經損害：
1、藥物治療：如因為周圍神經損害引起的神經源性肌肉萎縮，可以早期應用一些激素，大量的B族維生素，像維生素B1、維生素B12等來促進神經髓鞘的再生，從而改善神經源性肌肉萎縮。同時也可以應用一些營養(yǎng)神經的藥物，如胞磷膽堿、艾地苯醌等，改善線粒體的功能，從而促進神經的恢復，以促進神經萎縮，導致的神經源性肌肉萎縮問題；
2、康復治療：除上述的藥物治療外，神經源性肌肉萎縮的康復治療也非常重要，患者可以早期進行一些肢體康復運動，主動或者被動的活動，可以促進神經源性肌肉萎縮的恢復進程。另外，像紅外線、超短波、局部按摩、針灸等康復理療，都能促進神經源性肌肉萎縮的快速恢復。
二、其他特殊類型：
其他特殊類型的神經源性肌肉萎縮，如運動神經元病，因為前角細胞問題引起的神經源性肌肉萎縮，其治療存在特殊性，需要用針對神經源性肌肉萎縮的利魯唑或者依達拉奉，對癥藥物處理，同時康復治療也必不可少。
因此不同類型的神經源性肌肉萎縮，如周圍神經或者前角細胞引起的異常，其方式不一樣，采用的治療方法也存在一些差異。
