一般情況下，骨質(zhì)囊變沒有辦法自愈，但是大多數(shù)骨質(zhì)囊變可能并不引起任何癥狀，也不需要治療，所以也不存在治愈的可能性。而且不同部位、不同原因造成的骨質(zhì)囊變，其癥狀不一樣，所選擇的治療方案也不一樣。
在非負(fù)重區(qū)，如脊柱或者肩胛骨、骨盆髂骨上有囊性改變，這些囊性改變在不引起任何癥狀的情況下，不需要處理，只需要對癥觀察即可。如果在觀察的過程中，囊變沒有進(jìn)一步增加，也沒有引起癥狀，就可以帶病生存，長時間觀察即可。
如果骨質(zhì)囊變發(fā)生在人體負(fù)重骨頭的邊緣，破壞皮質(zhì)，比如長骨干骨折，或者下肢脛骨的骨囊腫，影響骨頭強(qiáng)度就要處理，否則會造成病理性骨折。此外，因股骨頭壞死所致的囊變不可能自愈，而且會隨著病情加重進(jìn)一步發(fā)生塌陷，最終導(dǎo)致晚期股骨頭壞死，這種情況需要通過手術(shù)進(jìn)行處理。
