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自身免疫性肝炎和其他的肝炎之間，在臨床表現上沒有明顯的區(qū)別。患者也是有乏力，與肝功能受損的情況輕重有關，同時會伴有食欲減退、厭吃油膩食物。嚴重的患者會有惡心、腹脹、肝區(qū)不適或者肝區(qū)疼痛，也有些患者會有皮膚、鞏膜的黃染、濃茶水色尿。對于這樣的表現，就要進一步做檢查，不能通過癥狀判斷肝損傷的原因。

對于自身免疫性肝炎的患者，做肝臟相關的自身抗體檢查，表現為抗核抗體水平升高，或者抗肝腎微粒抗體水平升高，同時會有免疫球蛋白中IgG水平的升高。這種情況下初步判斷是自身免疫性肝炎，如果診斷得不是特別確切，可以做肝組織的活檢。肝組織病理上，自身免疫性肝炎有特征性的表現，根據這些特點就可以作出判斷，根據患者的情況，可以給出有效的治療方案。