根據甲狀腺自身抗體陽性，可以診斷為自身免疫甲狀腺炎，但是要想診斷為橋本甲狀腺炎還需要加一個條件，即甲狀腺腫大。臨床上可以通過甲狀腺觸診或甲狀腺超聲來判斷，若甲狀腺增大，則為經典的橋本甲狀腺炎。若甲狀腺無明顯增大，有可能是萎縮性甲狀腺炎。
橋本甲狀腺炎起病隱匿，進展緩慢，多數患者以甲狀腺腫或甲減癥狀就診。當患者出現(xiàn)甲減后，可有怕冷、心動過緩、便秘、甚至黏液性水腫等表現(xiàn)。
橋本甲狀腺炎作為常見的自身免疫甲狀腺炎，臨床特點是甲狀腺內有大量淋巴細胞浸潤，在外周血中有針對甲狀腺抗原的自身抗體，如甲狀腺過氧化物酶抗體、甲狀腺球蛋白抗體。還有些患者會存在促甲狀腺激素受體抗體，TRAb又可以分為TSAb、TBAb，若TRAb陽性，臨床表現(xiàn)為甲減，則考慮TRAb為阻斷性抗體TBAb，若表現(xiàn)為甲亢，則為刺激性抗體TSAb。
TPOAb和TgAb滴度明顯增高是最具有意義的診斷指標，可持續(xù)數年或數十年。研究表明甲狀腺內的淋巴細胞浸潤程度與血清中的抗體滴度具有緊密的相關性，因此，通過血清中TPOAb和TgAb陽性診斷自身免疫甲狀腺炎。
