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兒童肌酸激酶同工酶升高一般提示心肌受損，提示心肌有炎癥、缺血。常見病因包括感染性心肌損傷、感染性心肌炎、風濕性心臟病、風濕性心肌炎、缺血性心臟病，甚至各種類型心肌病導致的心肌缺血。肌酸激酶同工酶升高程度也和病情嚴重程度有一定的相關性，如在普通急性心肌炎時肌酸激酶同工酶可能是輕度升高，提示炎癥可能是局灶或病變范圍比較小。

如果肌酸激酶顯著升高，提示心肌病灶比較廣泛或整個炎癥、水腫、壞死區(qū)域范圍較廣，對于疾病嚴重程度有一定臨床提示作用。在診斷患者是否有心肌損傷、心肌炎，甚至心肌缺血、壞死時，除肌酸激酶同工酶，還可以同時評估肌鈣蛋白、肌紅蛋白，綜合進行心肌損傷方面的評估。