如果父母染色體異常，建議患者做遺傳咨詢。染色體異常分為常染色體異常、性染色體異常、基因片段異常等，可能會導致不孕、孩子畸形、孩子染色體異常。如常染色體異常可能導致紅綠色盲，或21-三體綜合征、18三體綜合征等智力問題，還可能導致心臟、腎臟等器官畸形，如法洛四聯(lián)癥、多囊腎等。
染色體異常的父母，通常有不良孕史，如胎停育、自然流產(chǎn)史、孕中期胎死宮內(nèi)等。此時建議夫妻雙方檢查染色體是否異常并做遺傳咨詢，如咨詢是否適合再生孩子、若再生孩子會有什么嚴重的后果、是否需要做第三代試管嬰兒等。若做第三代試管嬰兒，可以生出沒有染色體畸形、器官畸形、智力問題等相對健康孩子。
