先天性膽總管囊腫手術(shù)方式是切除擴(kuò)張膽總管，將腸道空腸做空腸膽總管吻合，使膽汁能夠順暢進(jìn)入腸腔，能夠幫助消化，屬于一個(gè)常規(guī)手術(shù)。一般而言，此手術(shù)風(fēng)險(xiǎn)并不是很大。
手術(shù)后并發(fā)癥包括出血、膽瘺等，但這種情況一般發(fā)生的比較少。對(duì)于有炎癥、感染，以及反復(fù)感染發(fā)作的膽總管囊腫，或者周圍粘連很重的膽總管囊腫，手術(shù)風(fēng)險(xiǎn)就會(huì)增加，術(shù)后出血、膽瘺風(fēng)險(xiǎn)也會(huì)增加，對(duì)于術(shù)者要求會(huì)更高。對(duì)于有反復(fù)炎癥發(fā)作的病人，建議到正規(guī)三甲醫(yī)院肝膽外科做手術(shù)，可能會(huì)更加安全。
