光動力學療法不光是治療尖銳濕疣，對整個治療它的安全性都非常好。首先它不像傳統(tǒng)的手術(shù)如激光或者冷凍，不會留下疤痕，它最大的副反應(yīng)是光動力學反應(yīng)。光動力學反應(yīng)第一是疼痛，目前這是阻礙光動力學療法在臨床進一步推廣的一個最主要的問題，這個疼痛是一過性的，所以如果能夠把疼痛的問題解決，這個方法就應(yīng)用得非常好。其次，比如局部水腫、一過性的輕度糜爛、紅腫以及術(shù)后少數(shù)的色素沉著等，這些基本上都不會有太大問題。通過一些對癥的處理，比如抗炎、冷敷或者用滋潤霜，讓它自身修復(fù)，基本上都不會留下什么問題。在尖銳濕疣這個領(lǐng)域，最小的患者大概是6-8個月的小朋友，長在肛門的、長在外陰的，都是用光動力學療法，它確實很痛，但是全麻不是針對尖銳濕疣，全麻主要是針對光動力治療鮮紅斑痣，對小的尖銳濕疣患者，有一些鎮(zhèn)痛劑用不了，基本上都是要父母一起幫忙把他按倒，但是疼痛都是一過性，照完就好，當時會比較紅腫。三、五歲，七、八歲、二十歲青壯年以及九十歲以上的老人進行這個治療，包括合并HIV，合并心腦血管疾病，合并有糖尿病等，這些系統(tǒng)性疾病的患者來接受這個治療都沒有問題。所以相對其它的治療方法來說，這個方法它的安全性非常高。
