檢測幽門螺桿菌的手段較多，大致分為侵入性檢測和非侵入性檢測，具體如下：
1、侵入性檢測：需通過胃鏡獲取標本來進行檢測，包括快速尿素酶試驗，胃鏡檢查時，在胃竇附近5cm范圍內，夾取小塊標本，放置于試劑盒中。如標本內含有幽門螺桿菌分泌的尿素酶，會把試劑盒中的尿素分解成氨水，變?yōu)?span style="color:#000000">玫瑰紅色，同時堿性試劑酚紅也會變色。此外內鏡下取病理時，可在顯微鏡下直接看到幽門螺桿菌，也是檢測手段之一；
2、非侵入性檢測：如尿素呼氣試驗，包括碳13尿素呼氣試驗和碳14尿素呼氣試驗，是臨床上應用最廣范的檢查方法，能確定感染的嚴重程度，且可作為根除治療后的復查隨訪手段。還可通過抽血化驗，即從胳膊肘抽取血液，做抗體檢測。此外可進行膠體金檢測，臨床上較少應用，也難以對細菌感染的嚴重程度進行定量。抗體檢測作為普通大眾的篩查方法，操作較簡單，體檢時常用。
