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腦炎分為感染性腦炎和免疫性腦炎，感染性腦炎是由病原體直接侵犯腦實(shí)質(zhì)造成的腦部疾病，免疫性腦炎是由于自身免疫機(jī)制介導(dǎo)的腦實(shí)質(zhì)受損的疾病，這兩類疾病的形成過(guò)程不太一致。

臨床上導(dǎo)致腦炎的病原體有病毒、細(xì)菌、螺旋體、寄生蟲，這些病原微生物可以通過(guò)不同的途徑侵犯到腦實(shí)質(zhì)，部分經(jīng)過(guò)血行的直接播散，有的是鄰近器官的感染造成的腦組織的感染，如鼻竇炎、乳突炎造成骨質(zhì)的破壞以后導(dǎo)致感染性腦炎。病毒可以在腸道、呼吸道直接侵犯到神經(jīng)干，逆行進(jìn)到腦組織造成感染性腦炎。

免疫性的腦炎多數(shù)是由于免疫機(jī)制導(dǎo)致的腦實(shí)質(zhì)受損。常見的免疫性腦炎，比如抗NMDA受體腦炎，是體內(nèi)的抗NMDA受體抗體介導(dǎo)的腦炎，都與免疫相關(guān)，有的患者是有畸胎瘤或者合并其他的腫瘤導(dǎo)致腦炎。其他抗體介導(dǎo)的腦炎，有些是由免疫機(jī)制介導(dǎo)，有些有合并的腫瘤產(chǎn)生的特異性的抗體，是針對(duì)神經(jīng)組織的抗體介導(dǎo)的腦炎。